Heute das Ganze nochmal ausprobiert. 🙂
Unter "Werkzeuge/Allgemeine Einstellungen"
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Danach auf "Synchronisieren" klicken. Nach kurzer Zeit fragt er nach dem fehlenden Passwort. Passwort eingeben und kurze Zeit später waren alle Daten wieder da. Diesmal ging das ruckzuck.
Joplin 1.0.111 (prod, linux)